菌肥拌种对植物的生长很重要，生物菌肥（也称微生物菌肥）拌种有促进作物出苗和分蘖生长作用，能够提高各主要器官干物质积累量。在减少化肥用量同时用生物菌肥拌种处理的情况下，与常规施用化肥相比，产量和品质均高于后者，且可以改善土壤环境，如丰富土壤微生物群体，疏松土壤，改善土团粒结构等等。但菌肥的施用方法也有很多门道，下面简单谈谈：
1、选用质量合格的微生物肥料

质量低下、杂菌含量高或过期的产品不能施用。应选择有可靠技术背景和技术来源、质量性能稳定的菌肥，如百事康复合微生物肥。施美达复合微生物肥是由中国微生物界著名专家最新研制开发的新一代高科技复合微生物菌肥，几代产品在全国推广了十多年，质量稳定，品牌响亮。
2、尽量减少微生物的死亡

菌肥要避免阳光直射，拌种时应在阴凉处操作，拌种后要及时播种，并立即覆土。对于不同产品其微生物菌种的活性差异较大，百事康微生物菌肥的菌种为全芽孢（芽孢功能类似“防弹衣”），比一般产品的菌种对温度、酸碱度、紫外线的抗逆性好得多。当然，即便这样，菌肥也应避免与有害农药、化肥混合施用。
3、创造适宜的土壤环境

土壤过分干燥时，应及时灌浇，大雨后要及时排除田间积水，应改良土壤，合理耕作，提高土壤的通透性。应针对性地补施微生物必须的矿质营养。
4、量体裁衣选择菌肥

有些菌肥只含有根瘤菌，那就只可在豆科作物上应用，有的菌肥只含钾细菌（硅酸盐菌肥），对缺钾土壤和作物效果较好，但对氮、磷贡献就太小了。而有些较好的菌肥，如施美达复合微生物肥，属复合菌种，同时具有解磷、解钾和固氮等多重作用，可以在各种作物上应用，增产增收效果奇特。